RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608647.5

LINC00635-220, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 561 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-220ENST00000608647 GAGE2BQ13066 116 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 MAJINQ3KP22 176 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 Q6ZRP5 223 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 DPH3Q96FX2 82 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 HSPG2P98160 4391 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.72□□□□□ -1.49
LINC00635-220ENST00000608647 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.71□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 SCXQ7RTU7 201 aa5.71□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 STPG4Q8N801 248 aa5.71□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 A0A087WYN8 130 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 C7orf33Q8WU49 177 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 COPS9Q8WXC6 57 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF815PA8K554 130 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 EPM2AB3EWF7 344 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 TIMM17BO60830 172 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 CHTF8P0CG12 524 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 PFN2P35080 140 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 XGP55808 180 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 LINC00158P58513 81 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 GAGE2EQ4V326 116 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 TMEM238C9JI98 176 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 ATOH7Q8N100 152 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 A0A0J9YXY3 114 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 PANO1I0J062 215 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 Q6ZVH6 145 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 VAMP8Q9BV40 100 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.67□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 M0QXV9 152 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 SMIM13P0DJ93 91 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 Q8N1X5 172 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00635-220ENST00000608647 HERC1Q15751 4861 aa5.65□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.64□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SPANXCQ9NY87 97 aa5.64□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.64□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.64□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 A0A1W2PNN7 141 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 DLEU1O43261 78 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 NDUFC2O95298 119 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 IFITM1P13164 125 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 UBE2BP63146 152 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 S100A12P80511 92 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 FAT1Q14517 4588 aa5.63□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 A0A0U1RRA0 63 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 COX8AP10176 69 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SPATA45Q537H7 98 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 PYY3Q5JQD4 70 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 Q5VSD8 79 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 C22orf24Q9Y442 160 aa5.62□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 FAM168BA1KXE4 195 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 M0R378 163 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SMIM6P0DI80 62 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 VPREB1P12018 145 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 HAMPP81172 84 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 PCP2Q8IVA1 136 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 LITAFQ99732 161 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.6□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.6□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.6□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 DAND5Q8N907 189 aa5.59□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.59□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 HIGD1BQ9P298 99 aa5.59□□□□□ -1.51
LINC00635-220ENST00000608647 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
LINC00635-220ENST00000608647 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.58□□□□□ -1.52
LINC00635-220ENST00000608647 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.58□□□□□ -1.52
LINC00635-220ENST00000608647 LINC00167Q96N53 147 aa5.58□□□□□ -1.52
LINC00635-220ENST00000608647 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms