RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.68□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.67□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 PRR15LQ9BU68 103 aa7.67□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 TEN1Q86WV5 123 aa7.66□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 CHTF8P0CG12 524 aa7.65□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SEH1L-208ENST00000590843 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.65□□□□□ -1.19
SEH1L-208ENST00000590843 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.65□□□□□ -1.19
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SEH1L-208ENST00000590843 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.63□□□□□ -1.19
SEH1L-208ENST00000590843 ETDBQ3ZM63 59 aa7.63□□□□□ -1.19
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SEH1L-208ENST00000590843 hDV103S1A0JD37 113 aa7.62□□□□□ -1.19
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SEH1L-208ENST00000590843 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.61□□□□□ -1.19
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SEH1L-208ENST00000590843 A0A1B0GW54 56 aa7.6□□□□□ -1.19
SEH1L-208ENST00000590843 FXYD2P54710 66 aa7.6□□□□□ -1.19
SEH1L-208ENST00000590843 PRR34Q9NV39 138 aa7.6□□□□□ -1.19
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SEH1L-208ENST00000590843 Q5VSD8 79 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZRX8 168 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.57□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 C5orf47Q569G3 176 aa7.57□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.56□□□□□ -1.2
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SEH1L-208ENST00000590843 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.56□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00575Q6W349 94 aa7.55□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 TRIAP1O43715 76 aa7.55□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 SCXQ7RTU7 201 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 Q96NJ1 140 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 M0R2T5 61 aa7.53□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SEH1L-208ENST00000590843 GAS8-AS1O95177 125 aa7.52□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.52□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 IGKV2-30P06310 120 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZSA8 131 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 Q9UF83 564 aa7.5□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.5□□□□□ -1.21
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SEH1L-208ENST00000590843 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 TAX1BP3O14907 124 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 MUC4Q99102 2169 aa7.49□□□□□ -1.21
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SEH1L-208ENST00000590843 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 Q8N3U1 123 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 KIAA0087Q14695 138 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 STAB1Q9NY15 2570 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 C15orf56Q8N910 161 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-208ENST00000590843 SERP2Q8N6R1 65 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 HCG22E2RYF7 251 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.45□□□□□ -1.22
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SEH1L-208ENST00000590843 C20orf197Q8N268 126 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 VPREB1P12018 145 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.43□□□□□ -1.22
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SEH1L-208ENST00000590843 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 CXCL6P80162 114 aa7.41□□□□□ -1.22
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SEH1L-208ENST00000590843 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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SEH1L-208ENST00000590843 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.4□□□□□ -1.22
SEH1L-208ENST00000590843 NDUFC1O43677 76 aa7.4□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 CD164Q04900 197 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 FAM168BA1KXE4 195 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 SPRR4Q96PI1 79 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 V9GYY9 64 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF292O60281 2723 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 COL6A5A8TX70 2615 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV6-57P01721 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 LINC01546A6NGU7 62 aa7.37□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 IMUPQ9GZP8 106 aa7.37□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 C9orf92A6NGG3 77 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00208Q96KT6 92 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 UQCRQO14949 82 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-208ENST00000590843 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.35□□□□□ -1.23
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