RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 RYR2Q92736 4967 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 IFITM1P13164 125 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 LINC00158P58513 81 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 C14orf144Q96I85 54 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 HIGD1BQ9P298 99 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 SMIM13P0DJ93 91 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 TAL2Q16559 108 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 C10orf25Q5T742 122 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 SPANXCQ9NY87 97 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-213ENST00000589475 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.53□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAH2Q9P225 4427 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 C16orf90A8MZG2 172 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 PFN2P35080 140 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 HSD52Q0P140 79 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 HIST1H4GQ99525 98 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 Q6ZRP5 223 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 LITAFQ99732 161 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 PRO1933Q9H354 126 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A0U1RRA0 63 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A1B0GVY2 172 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 M0R143 59 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 NDUFC2O95298 119 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 GAGE2BQ13066 116 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 GAGE2EQ4V326 116 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A096LNI7 61 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DDTP30046 118 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DAND5Q8N907 189 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 Q6ZSA8 131 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 CEND1Q8N111 149 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 DPH3Q96FX2 82 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 M0R378 163 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 VPREB1P12018 145 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 NPC2P61916 151 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 CTAG1AP78358 180 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 LINC01620Q4KN68 170 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A0B4J2C4 111 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 A4D1N5 150 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 A6NDN8 102 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 M0QXV9 152 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 CHTF8P0CG12 524 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 KRTAP10-1P60331 282 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 RAB37Q96AX2 223 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM126AQ9H061 195 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A087WYN8 130 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 EPM2AB3EWF7 344 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 NCR3O14931 201 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 FXYD2P54710 66 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 C7orf33Q8WU49 177 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 C22orf24Q9Y442 160 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A1B0GWB2 263 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A1W2PNN7 141 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms