RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6Q795 121 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM126AQ9H061 195 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 SNCGO76070 127 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 SPAG11BQ08648 103 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 ENHOQ6UWT2 76 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 MT-ATP8P03928 68 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00167Q96N53 147 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 KLK12Q9UKR0 248 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 HIVEP1P15822 2718 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1B0GV72 72 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 H3BQ85 93 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 Q75L30 129 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A087WYN8 130 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZTC4 211 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C2orf48Q96LS8 159 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 CUBNO60494 3623 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 LECT2O14960 151 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 IMUPQ9GZP8 106 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 RETNQ9HD89 108 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C22orf24Q9Y442 160 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 IGLV6-57P01721 117 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 ESRGQ1W209 222 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00643Q86TS7 51 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 Q8N814 137 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 Q9HAA7 133 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C10orf25Q5T742 122 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C6orf223Q8N319 242 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00575Q6W349 94 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 VWFP04275 2813 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 NCR3O14931 201 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 C6orf99Q4VX62 202 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-208ENST00000587914 ATRQ13535 2644 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 M0R378 163 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC32Q5I0X7 151 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 LCE1DQ5T752 114 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 C15orf56Q8N910 161 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 RMI2Q96E14 147 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 hADV29S1A0JD25 119 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 LCE4AQ5TA78 99 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 Q8NDZ9 215 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 DIRC1Q969H9 104 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 UPK3BQ9BT76 320 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 CCKP06307 115 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 PDE6GP18545 87 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 SYCNQ0VAF6 134 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZRU5 148 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 F8P00451 2351 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 K7EIL1 84 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 SLPIP03973 132 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 COX7BP24311 80 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6JHZ5 121 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 218.3 ms