RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q6Q795	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	SNCG	O76070	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A1B0GV72	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914		H3BQ85	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q75L30	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A087WYN8	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q6ZTC4	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	CUBN	O60494	3623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	LECT2	O14960	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	RETN	Q9HD89	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	ESRG	Q1W209	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q8N814	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q9HAA7	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	VWF	P04275	2813 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	NCR3	O14931	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATR	Q13535	2644 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914		M0R378	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	RMI2	Q96E14	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q8NDZ9	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCK	P06307	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDE6G	P18545	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q6ZRU5	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	F8	P00451	2351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7EIL1	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLPI	P03973	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	COX7B	P24311	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q6JHZ5	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms