RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C22orf24Q9Y442 160 aa20.6■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa20.58■□□□□ 0.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP73-AS1Q9UF72 201 aa20.58■□□□□ 0.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YXY3 114 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR3P79522 188 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa20.55■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TTTY13Q9BZ97 58 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 INAFM2P0DMQ5 153 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2BP63146 152 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKAPP1Q8N9T2 125 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00167Q96N53 147 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa20.44■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf137Q5JT78 98 aa20.43■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MIEN1Q9BRT3 115 aa20.43■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE10A6NGK3 116 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LITAFQ99732 161 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB1D4Q6XE38 83 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL37AP8A6NKH3 93 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R378 163 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM238C9JI98 176 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2D-28P01615 120 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPC2P61916 151 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV7-43P04211 117 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCR3O14931 201 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFC2O95298 119 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00308Q8TCZ7 52 aa20.3■□□□□ 0.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPANXCQ9NY87 97 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZVH6 145 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAMP8Q9BV40 100 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYCBP2O75592 4640 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCE1O60756 84 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYY3Q5JQD4 70 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAM16Q9Y3D7 125 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX8AP10176 69 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA45Q537H7 98 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 COPS9Q8WXC6 57 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM126AQ9H061 195 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFITM1P13164 125 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 REG3GQ6UW15 175 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPDPFQ9H3Y8 114 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF861PO60384 105 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLEU1O43261 78 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIRC1Q969H9 104 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNQ1DNQ9H478 68 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL28P46779 137 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A12P80511 92 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A7L2Q5SY68 101 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf144Q96I85 54 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXTP01178 125 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUSTN1Q8IVN3 82 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0Y9J4 135 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV6-57P01721 117 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2AP49459 152 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00518Q8N0U6 118 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRR1AP35321 89 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A34Q6PIV7 304 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRLHP81277 87 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00337Q8N6G1 96 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13C6PQ8NH95 151 aa20.02■□□□□ 0.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBY1Q9Y3M2 126 aa20.01■□□□□ 0.79
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