RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557679.5

ZNF410-223, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5

Gene ZNF410, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-223	ENST00000557679	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	SERF1A	O75920	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	PLN	P26678	52 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF410-223	ENST00000557679	NUPR1	O60356	82 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	FABP4	P15090	132 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	PFN2	P35080	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HERVK_113	P61574	105 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HERV-K104	P63124	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	PRY	O14603	147 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	LINC00158	P58513	81 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	SCO1	O75880	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	DPM2	O94777	84 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	IGKC	P01834	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	S100A1	P23297	94 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	NMU	P48645	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679		A0A0A0MQY5	61 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	LEPROT	O15243	131 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	S100A12	P80511	92 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	C20orf202	A1L168	122 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679		H0Y9J4	135 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF861P	O60384	105 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	BCE1	O60756	84 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	AKR1D1	P51857	326 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF410-223	ENST00000557679	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679		J3QQQ9	107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	VPREB1	P12018	145 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	UBE2A	P49459	152 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679		A0A0U1RRA0	63 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679		M0R378	163 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	FAT1	Q14517	4588 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679		E9PLD3	99 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTDAP	P60985	99 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	S100A6	P06703	90 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	S100A2	P29034	98 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ZNF410-223	ENST00000557679	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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