RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-238	ENST00000556288	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-238	ENST00000556288	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01549	A6NIU2	74 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFA1	O15239	70 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	HBD	P02042	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf79	P0CE67	100 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2D1	P51668	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTDAP	P60985	99 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	HERVK_113	P63121	156 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SEC11A	P67812	179 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA45	Q537H7	98 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf82	Q6UX34	121 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	AMELX	Q99217	191 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	CST9L	Q9H4G1	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WZ39	114 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A096LNI7	61 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PANO1	I0J062	215 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP5L	O75964	103 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SPINK8	P0C7L1	97 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf48	Q96LS8	159 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01546	A6NGU7	62 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BRM9	83 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LEPROTL1	O95214	131 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	COX7B2	Q8TF08	81 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C7orf33	Q8WU49	177 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAH2	Q9P225	4427 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PFN2	P35080	140 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01545	Q5VT33	79 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZSA8	131 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A096LNJ9	63 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0U1RRA0	63 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		F8WDY8	70 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP10-5	P60370	271 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0087	Q14695	138 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		Q8IZM0	81 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PNN7	141 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		A6NDN8	102 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf86	A6NJI1	115 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288		F8VRH5	84 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	COX8A	P10176	69 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00158	P58513	81 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2B	P63146	152 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	BATF	Q16520	125 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	PKHD1	P08F94	4074 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.94
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf137	Q5JT78	98 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288		Q8NBF4	154 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288		K7ERU9	68 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288		M0QXV9	152 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATXN3-238	ENST00000556288	TAX1BP3	O14907	124 aa		2.89	□□□□□ -1.95

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