RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 M0R2N4 97 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 DEFB130BP0DP73 79 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 DEFB130AP0DP74 79 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 C20orf197Q8N268 126 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 XCL1P47992 114 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 Q8NDZ9 215 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WZ39 114 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 Q8N814 137 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 A0A096LPF7 62 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 LINC00167Q96N53 147 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 HTN3P15516 51 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 Q8N3U1 123 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 NDUFC2O95298 119 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 SNURFQ9Y675 71 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 EPM2AB3EWF7 344 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 C6orf99Q4VX62 202 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 FAM236CP0DP71 79 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 CELA1Q9UNI1 258 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 H7BZZ5 65 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 X6R8D5 127 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 RMI2Q96E14 147 aa6.22□□□□□ -1.41
THBS3-211ENST00000541990 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.21□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 UBL5Q9BZL1 73 aa6.21□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.21□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 PRO0628Q9UI54 55 aa6.21□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 SCXQ7RTU7 201 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZQT0 140 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 COL7A1Q02388 2944 aa6.2□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 HAMPP81172 84 aa6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 C16orf74Q96GX8 76 aa6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 KIAA0087Q14695 138 aa6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 Q8IZM0 81 aa6.19□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 FBN3Q75N90 2809 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 F8WDY8 70 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 GYPEP15421 78 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZVQ6 151 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 C6orf223Q8N319 242 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 TENM2Q9NT68 2774 aa6.18□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 C10orf25Q5T742 122 aa6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LINC00575Q6W349 94 aa6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LYSTQ99698 3801 aa6.17□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 F8WEM9 126 aa6.16□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.16□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.16□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.16□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.15□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZQY7 126 aa6.15□□□□□ -1.42
THBS3-211ENST00000541990 K7EIL1 84 aa6.15□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 BCE1O60756 84 aa6.15□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 Q8NAQ8 132 aa6.15□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 TGP01266 2768 aa6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 APOC4P55056 127 aa6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 KLKP1Q107X0 134 aa6.14□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 Q8N9L7 120 aa6.13□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.13□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.13□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 A0A0J9YWU9 116 aa6.13□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 DAD1P61803 113 aa6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZTC4 211 aa6.12□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GUV1 79 aa6.11□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.11□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 MUC7Q8TAX7 377 aa6.11□□□□□ -1.43
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