RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477		F8WDY8	70 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	LEPROT	O15243	131 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	LINC00158	P58513	81 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	NPC2	P61916	151 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-222	ENST00000539477	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	HERVK_113	P61574	105 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477		E9PLD3	99 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	NMU	P48645	174 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C12orf57	Q99622	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PCP2	Q8IVA1	136 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C20orf202	A1L168	122 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	UBE2B	P63146	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477		A0A0J9YXY3	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	NCR3	O14931	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	PCP4	P48539	62 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	VPREB1	P12018	145 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	COX17	Q14061	63 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MLH1-222	ENST00000539477	HERV-K104	P63124	156 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	AKR1D1	P51857	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	LITAF	Q99732	161 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	TNXB	P22105	4242 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477		A6NJY4	79 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	PRLH	P81277	87 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MLH1-222	ENST00000539477	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.65	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.65	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.65	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.65	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477		M0R378	163 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.63	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	BCE1	O60756	84 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	TIMM17B	O60830	172 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	COX8A	P10176	69 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	DDT	P30046	118 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	UBE2A	P49459	152 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477		J3QL48	77 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477		A0A1B0GV90	55 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477		H0Y9J4	135 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF861P	O60384	105 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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