RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C2orf48Q96LS8 159 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 F8VRH5 84 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 APOMO95445 188 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 FABP2P12104 132 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 HERVK_113P63121 156 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM141Q96I45 108 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 K7EMI3 77 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 HERVK_113P61574 105 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 LINC01545Q5VT33 79 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 RAB37Q96AX2 223 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 CARD19Q96LW7 228 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 LYSTQ99698 3801 aa3.26□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 A0A1B0GVY2 172 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 F8W1H4 67 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SEC11AP67812 179 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF815PA8K554 130 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 H7C423 109 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 PFN2P35080 140 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 NPC2P61916 151 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SFTA2Q6UW10 78 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 TOMM6Q96B49 74 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C11orf86A6NJI1 115 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 J3QQQ9 107 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SNCGO76070 127 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SYCNQ0VAF6 134 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 HIST1H4GQ99525 98 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 PRR34Q9NV39 138 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.25□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 H3BRM9 83 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 CDK2AP2O75956 126 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 PLNP26678 52 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 Q6Q795 121 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 A0A087WZ39 114 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 EPM2AB3EWF7 344 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 H3BUT2 72 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 H7C2G1 150 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 A0A1B0GWB2 263 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 Q5XG85 94 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C2orf82Q6UX34 121 aa3.24□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SCXQ7RTU7 201 aa3.23□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 A0A1W2PPM0 123 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 NDUFA1O15239 70 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 COX8AP10176 69 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 ETDBQ3ZM63 59 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 Q6ZRU5 148 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C15orf56Q8N910 161 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 BRK1Q8WUW1 75 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 TIMM17AQ99595 171 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.22□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 IGIPA6NJ69 53 aa3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 Q1RN00 199 aa3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.21□□□□□ -1.89
CLVS1-205ENST00000519846 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 UBE2BP63146 152 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 Q5VSD8 79 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 DAND5Q8N907 189 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 A0A087WYN8 130 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 LINC01549A6NIU2 74 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.21□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 K7ERJ3 54 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 UQCRQO14949 82 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 SLPIP03973 132 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 A0A096LNI7 61 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 UBE2D1P51668 147 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM258P61165 79 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 C10orf25Q5T742 122 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 C7orf33Q8WU49 177 aa3.2□□□□□ -1.9
CLVS1-205ENST00000519846 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms