RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 C14orf144Q96I85 54 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 ERG28Q9UKR5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00158P58513 81 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 C12orf57Q99622 126 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0J9YXY3 114 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 PFN2P35080 140 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 TIMM17BO60830 172 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM13P0DJ93 91 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0U1RRA0 63 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM238C9JI98 176 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 GAGE2BQ13066 116 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 GAGE2EQ4V326 116 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZRP5 223 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZVH6 145 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 COPS9Q8WXC6 57 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-208ENST00000511807 TSTD3H0UI37 97 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 H3BS24 57 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 OXTP01178 125 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 PTTG1IPP53801 180 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 PRO1933Q9H354 126 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 HIGD1BQ9P298 99 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 DPH3Q96FX2 82 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 LITAFQ99732 161 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPANXCQ9NY87 97 aa7.2□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 A0A096LNI7 61 aa7.19□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.19□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 IFITM1P13164 125 aa7.19□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 DAND5Q8N907 189 aa7.18□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H4GQ99525 98 aa7.18□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.18□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.18□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 TAL2Q16559 108 aa7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 PANO1I0J062 215 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 CHTF8P0CG12 524 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 NPC2P61916 151 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFC2O95298 119 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 HSD52Q0P140 79 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WYN8 130 aa7.12□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.12□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PNN7 141 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 VPREB1P12018 145 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 CEND1Q8N111 149 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 FAM168BA1KXE4 195 aa7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 M0R378 163 aa7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 DDTP30046 118 aa7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 CTAG1AP78358 180 aa7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.09□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 A4D1N5 150 aa7.09□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 M0QXV9 152 aa7.09□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 M0R143 59 aa7.09□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 C22orf24Q9Y442 160 aa7.09□□□□□ -1.27
UBE2B-208ENST00000511807 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.07□□□□□ -1.28
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