RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC32Q5I0X7 151 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01600Q96MT4 127 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE2BQ13066 116 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE2EQ4V326 116 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 C6orf99Q4VX62 202 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-208ENST00000510829 SYCNQ0VAF6 134 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 C15orf56Q8N910 161 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 hADV29S1A0JD25 119 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-208ENST00000510829 DIRC1Q969H9 104 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf48Q96LS8 159 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 C22orf24Q9Y442 160 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GX51 115 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00575Q6W349 94 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 RMI2Q96E14 147 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV6-57P01721 117 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R378 163 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 COX7BP24311 80 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZQY7 126 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00643Q86TS7 51 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L23D6RBM5 183 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZRP5 223 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 VPREB1P12018 145 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 PSCAO43653 123 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 CASC10Q5T4H9 136 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 MDFIQ99750 246 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 Q6Q795 121 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 F8WDY8 70 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00167Q96N53 147 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00846Q9NV44 126 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 GHRHP01286 108 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 CCKP06307 115 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 DSCR8Q96T75 97 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 C7orf33Q8WU49 177 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-208ENST00000510829 IMUPQ9GZP8 106 aa7.21□□□□□ -1.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM168BA1KXE4 195 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BQ85 93 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 UPK3BQ9BT76 320 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 B9D2Q9BPU9 175 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6JHZ5 121 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 HAMPP81172 84 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 B5MCH6 92 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZQT0 140 aa7.16□□□□□ -1.26
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