RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 C5orf52A6NGY3 159 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01545Q5VT33 79 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 COX7B2Q8TF08 81 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 DPM2O94777 84 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 IGKCP01834 107 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 S100A6P06703 90 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS2P07478 247 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PLNP26678 52 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PET117Q6UWS5 81 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PTTG1IPP53801 180 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 KRTDAPP60985 99 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CKS1BP61024 79 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZRP5 223 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C7orf33Q8WU49 177 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.59□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CXCL5P42830 114 aa4.59□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 GAGE2BQ13066 116 aa4.59□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.59□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PNN7 141 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 LEPROTO15243 131 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 S100A2P29034 98 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 MAJINQ3KP22 176 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 FAM168BA1KXE4 195 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 E9PLD3 99 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 GAGE2EQ4V326 116 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 STPG4Q8N801 248 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 J3QQQ9 107 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 HERVK_113P61574 105 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 ATOH7Q8N100 152 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 ERG28Q9UKR5 140 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 C20orf202A1L168 122 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 PFN2P35080 140 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 SFTA2Q6UW10 78 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 REG3GQ6UW15 175 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 COX17Q14061 63 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0U1RRA0 63 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 C9orf118A6NHY6 69 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM13P0DJ93 91 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 HERV-K104P63124 156 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 Q8NDZ9 215 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0J9YXY3 114 aa4.52□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 NMUP48645 174 aa4.52□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00158P58513 81 aa4.52□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 SCGB1D1O95968 90 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 AKR1D1P51857 326 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 PCP2Q8IVA1 136 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 DAND5Q8N907 189 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 LITAFQ99732 161 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF815PA8K554 130 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 M0QXV9 152 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 VPREB1P12018 145 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 C22orf24Q9Y442 160 aa4.5□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.49□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 PYY3Q5JQD4 70 aa4.49□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.49□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.49□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.49□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00587B1AMM8 73 aa4.48□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
C9orf135-204ENST00000495399 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms