RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.21□□□□□ -0.29
NELFE-211ENST00000492185 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 H0YGX0 51 aa13.19□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZRU5 148 aa13.19□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 OR13C6PQ8NH95 151 aa13.19□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 Q9HAA7 133 aa13.19□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 APLNQ9ULZ1 77 aa13.17□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.17□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 VPS25Q9BRG1 176 aa13.17□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 TMEM126AQ9H061 195 aa13.17□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 RMI2Q96E14 147 aa13.15□□□□□ -0.3
NELFE-211ENST00000492185 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.13□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 NCR3O14931 201 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 SYCNQ0VAF6 134 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 IGLV6-57P01721 117 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 A0A087WYN8 130 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 CASC10Q5T4H9 136 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 DNHD1Q96M86 4753 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 USP17L23D6RBM5 183 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 C22orf24Q9Y442 160 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-211ENST00000492185 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.08□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 VPREB1P12018 145 aa13.08□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 A0A1B0GX51 115 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 BAALC-AS2P0C853 105 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 SLPIP03973 132 aa13.06□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 LINC00167Q96N53 147 aa13.06□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZRP5 223 aa13.05□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 NUPR2A6NF83 97 aa13.04□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 LECT2O14960 151 aa13.03□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 C6orf99Q4VX62 202 aa13.02□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 CDIP1Q9H305 208 aa13.02□□□□□ -0.32
NELFE-211ENST00000492185 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa13.02□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 DNAL4O96015 105 aa13.02□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.01□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 M0R378 163 aa13□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 GAGE2EQ4V326 116 aa13□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.99□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.99□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.99□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 Q8N814 137 aa12.99□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.99□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 LINC00575Q6W349 94 aa12.97□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.97□□□□□ -0.33
NELFE-211ENST00000492185 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa12.95□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.95□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.94□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.94□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 TENM2Q9NT68 2774 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 DIRC1Q969H9 104 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 SIGMAR1Q99720 223 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 TTC32Q5I0X7 151 aa12.91□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.91□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 LYSTQ99698 3801 aa12.9□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
NELFE-211ENST00000492185 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa12.89□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 SNCGO76070 127 aa12.89□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.89□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.89□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.88□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 hADV29S1A0JD25 119 aa12.88□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 COX7BP24311 80 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 C7orf33Q8WU49 177 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 XGP55808 180 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 C14orf177Q52M58 125 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 FBN3Q75N90 2809 aa12.86□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.85□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 PSCAO43653 123 aa12.85□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 STARD9Q9P2P6 4700 aa12.84□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.84□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 ACYP1P07311 99 aa12.84□□□□□ -0.35
NELFE-211ENST00000492185 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.83□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 GAGE2BQ13066 116 aa12.82□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 FAM168BA1KXE4 195 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 MT-ATP8P03928 68 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 H3BQ85 93 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 SCGB1A1P11684 91 aa12.79□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.79□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.79□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132 ms