RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487935.1

OPTN-212, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 511 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-212ENST00000487935 Q6ZRP5 223 aa7.58□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.58□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 J3QQQ9 107 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 PTTG1IPP53801 180 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 GAGE2EQ4V326 116 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 PFN2P35080 140 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP10-8P60410 259 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 ERG28Q9UKR5 140 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 HERV-K104P63124 156 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 NMUP48645 174 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-212ENST00000487935 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.53□□□□□ -1.2
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OPTN-212ENST00000487935 ZNF815PA8K554 130 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 RNF213Q63HN8 5207 aa7.51□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 A0A1W2PNN7 141 aa7.51□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 SMIM13P0DJ93 91 aa7.51□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 COX17Q14061 63 aa7.51□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.51□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 LINC00587B1AMM8 73 aa7.5□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 A0A0J9YXY3 114 aa7.49□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.49□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 FAM168BA1KXE4 195 aa7.48□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 PCP2Q8IVA1 136 aa7.48□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.48□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 VAMP8Q9BV40 100 aa7.48□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.48□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 PYY3Q5JQD4 70 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 C1orf137Q5JT78 98 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-212ENST00000487935 DAND5Q8N907 189 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 M0QXV9 152 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 SPATA45Q537H7 98 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 TIMM17BO60830 172 aa7.44□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.44□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 NPC2P61916 151 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 DIRC1Q969H9 104 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 TMEM238C9JI98 176 aa7.42□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 IGLV7-43P04211 117 aa7.42□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 COX8AP10176 69 aa7.42□□□□□ -1.22
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OPTN-212ENST00000487935 LITAFQ99732 161 aa7.42□□□□□ -1.22
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OPTN-212ENST00000487935 UBE2BP63146 152 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 C14orf144Q96I85 54 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 C22orf24Q9Y442 160 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 LPAP08519 4548 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 GAGE10A6NGK3 116 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 S100A12P80511 92 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 Q8NDZ9 215 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-212ENST00000487935 H0Y9J4 135 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 NCR3O14931 201 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SPANXCQ9NY87 97 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 DLEU1O43261 78 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SMIM6P0DI80 62 aa7.37□□□□□ -1.23
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OPTN-212ENST00000487935 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.36□□□□□ -1.23
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OPTN-212ENST00000487935 LINC00167Q96N53 147 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 M0R378 163 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 NDUFC2O95298 119 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 IFITM1P13164 125 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 IGKV2D-28P01615 120 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-212ENST00000487935 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.34□□□□□ -1.23
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