RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 J3QQQ9 107 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 VPS25Q9BRG1 176 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 SFTA2Q6UW10 78 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 NMUP48645 174 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 HERV-K104P63124 156 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 MAJINQ3KP22 176 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM238C9JI98 176 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 VAMP3Q15836 100 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZSA8 131 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 ERG28Q9UKR5 140 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A096LNI7 61 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 GAGE2BQ13066 116 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 COX17Q14061 63 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZRP5 223 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 PANO1I0J062 215 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 OXTP01178 125 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 CHTF8P0CG12 524 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 SCGB1A1P11684 91 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 PFN2P35080 140 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF815PA8K554 130 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 GAGE2EQ4V326 116 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0J9YXY3 114 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 SMIM13P0DJ93 91 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00158P58513 81 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 PCP2Q8IVA1 136 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 TAX1BP3O14907 124 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 DPH3Q96FX2 82 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0U1RRA0 63 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WYN8 130 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PNN7 141 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 TIMM17BO60830 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SCXQ7RTU7 201 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 MT1HL1P0DM35 61 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 COX8AP10176 69 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 LITAFQ99732 161 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM168BA1KXE4 195 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 DAND5Q8N907 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1B0GV72 72 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 A6NDN8 102 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 GAGE10A6NGK3 116 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 K7EP34 96 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZVH6 145 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 SPANXCQ9NY87 97 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1-207ENST00000471650 VPREB1P12018 145 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 Q8NDZ9 215 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 C22orf24Q9Y442 160 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 LPAP08519 4548 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 C9orf118A6NHY6 69 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212.3 ms