RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0U1RRA0 63 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PNN7 141 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 FAM168BA1KXE4 195 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00587B1AMM8 73 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 EPM2AB3EWF7 344 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 TRIAP1O43715 76 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 VAMP8Q9BV40 100 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-211ENST00000460176 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.47□□□□□ -1.37
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GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 DPH3Q96FX2 82 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 LITAFQ99732 161 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 TIMM17BO60830 172 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 DAND5Q8N907 189 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 COX8AP10176 69 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.43□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 Q8NDZ9 215 aa6.43□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 DLEU1O43261 78 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM6P0DI80 62 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 C14orf144Q96I85 54 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM238C9JI98 176 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 M0QXV9 152 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 VPREB1P12018 145 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 SPANXCQ9NY87 97 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.41□□□□□ -1.38
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GARNL3-211ENST00000460176 C22orf24Q9Y442 160 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-211ENST00000460176 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 S100A12P80511 92 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZVH6 145 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.38□□□□□ -1.39
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GARNL3-211ENST00000460176 LINC00167Q96N53 147 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 HIGD1BQ9P298 99 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE10A6NGK3 116 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 NCR3O14931 201 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 NDUFC2O95298 119 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 IFITM1P13164 125 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N1X5 172 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 HSPG2P98160 4391 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 M0R378 163 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2D-28P01615 120 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2BP63146 152 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 Q5VSD8 79 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 COPS9Q8WXC6 57 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 C12orf57Q99622 126 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-211ENST00000460176 RYR1P21817 5038 aa6.34□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H4GQ99525 98 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 PRO1933Q9H354 126 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.31□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 TAL2Q16559 108 aa6.31□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 A4D1N5 150 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV6-57P01721 117 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 DDTP30046 118 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 PCP4P48539 62 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.3□□□□□ -1.4
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