RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DAND5Q8N907 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LINC01546A6NGU7 62 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LINC00614P0C842 121 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MT1HP80294 61 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PMCHL1Q16048 86 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.31□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.3□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.3□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 A0A096LNJ9 63 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGIPA6NJ69 53 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSBP1O75506 76 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 S100A6P06703 90 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.29□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 K7EMI3 77 aa7.28□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HBDP02042 147 aa7.28□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM126AQ9H061 195 aa7.28□□□□□ -1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 M0R378 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.27□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.27□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.27□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HERVK_113P63121 156 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 Q8NBF4 154 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 Q8NDZ9 215 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COX7B2Q8TF08 81 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOMM6Q96B49 74 aa7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C5orf52A6NGY3 159 aa7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPRR4Q96PI1 79 aa7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.25□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 VPREB1P12018 145 aa7.24□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FABP4P15090 132 aa7.24□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 S100A2P29034 98 aa7.23□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PFN2P35080 140 aa7.23□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CXCL5P42830 114 aa7.23□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.23□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LEPROTL1O95214 131 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPINK8P0C7L1 97 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 G0S2P27469 103 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 XP32Q5T750 250 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TIMM17AQ99595 171 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.21□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SEC11AP67812 179 aa7.21□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERASQ7Z444 233 aa7.21□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.21□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LINC01549A6NIU2 74 aa7.2□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATP5LO75964 103 aa7.2□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.2□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.2□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 H0Y8G0 127 aa7.19□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPINK1P00995 79 aa7.19□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NPSP0C0P6 89 aa7.19□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CFC1BP0CG36 223 aa7.19□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.18□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 Q8N377 158 aa7.18□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.17□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C3orf79P0CE67 100 aa7.17□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRTDAPP60985 99 aa7.17□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCOTHQ58A44 107 aa7.16□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.16□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.16□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.15□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PMVKQ15126 192 aa7.15□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CST9LQ9H4G1 147 aa7.15□□□□□ -1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.14□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.14□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.14□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PET117Q6UWS5 81 aa7.13□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERG28Q9UKR5 140 aa7.13□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AKR1D1P51857 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LINC01545Q5VT33 79 aa7.12□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C20orf202A1L168 122 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C11orf86A6NJI1 115 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 M0R2T5 61 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGLC3P0DOY3 106 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.11□□□□□ -1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms