RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf197Q8N268 126 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 Q8NDZ9 215 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 BCE1O60756 84 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 A0A096LPF7 62 aa10.19□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 INAFM1C9JVW0 142 aa10.19□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.19□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 Q5XG85 94 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf223Q8N319 242 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB4AO15263 64 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 PRO0255Q9UI72 69 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.17□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 WIPF1O43516 503 aa10.17□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.16□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.16□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 C4orf26Q17RF5 130 aa10.16□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.16□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 FAM236CP0DP71 79 aa10.16□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.15□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 ATRQ13535 2644 aa10.15□□□□□ -0.78
TOP3B-206ENST00000436282 M0R2N4 97 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 REG3AQ06141 175 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 MUC7Q8TAX7 377 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 X6R8D5 127 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB135Q30KP9 77 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZVQ6 151 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.13□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 H7BZZ5 65 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 PDE6GP18545 87 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV6-57P01721 117 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 HAMPP81172 84 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 H3BQ85 93 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N3U1 123 aa10.11□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZQY7 126 aa10.11□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 EPM2AB3EWF7 344 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 CXCL6P80162 114 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 KLKP1Q107X0 134 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf25Q5T742 122 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG11BQ08648 103 aa10.09□□□□□ -0.79
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0J9YWU9 116 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 HIVEP1P15822 2718 aa10.07□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 LYRM9A8MSI8 78 aa10.07□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.06□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 HTN3P15516 51 aa10.06□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 DIRC1Q969H9 104 aa10.05□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.05□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 DAD1P61803 113 aa10.04□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.04□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 SNURFQ9Y675 71 aa10.04□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 RMI2Q96E14 147 aa10.03□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CELA1Q9UNI1 258 aa10.03□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 APOC4P55056 127 aa10.03□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
TOP3B-206ENST00000436282 F8WEM9 126 aa10.01□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 COX7BP24311 80 aa10□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFC1O43677 76 aa10□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 SCXQ7RTU7 201 aa9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 PRR34Q9NV39 138 aa9.99□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 LELP1Q5T871 98 aa9.98□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.98□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 Q8NAQ8 132 aa9.97□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 KLK12Q9UKR0 248 aa9.97□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 MRAPQ8TCY5 172 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-206ENST00000436282 F8P00451 2351 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 NREPQ16612 68 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 MIFP14174 115 aa9.94□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 BPY2O14599 106 aa9.93□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 VPREB1P12018 145 aa9.93□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ERC2-IT1O76042 136 aa9.92□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.92□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 M0R378 163 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms