RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 K7EIL1 84 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H3BNG1 76 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C6orf99Q4VX62 202 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C15orf56Q8N910 161 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFC2O95298 119 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CASC10Q5T4H9 136 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N814 137 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GAGE2BQ13066 116 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MDFIQ99750 246 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6ZRP5 223 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV6-57P01721 117 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VPREB1P12018 145 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYCNQ0VAF6 134 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00575Q6W349 94 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6ZQY7 126 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L23D6RBM5 183 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C2orf48Q96LS8 159 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00167Q96N53 147 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00846Q9NV44 126 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM168BA1KXE4 195 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00643Q86TS7 51 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6Q795 121 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCKP06307 115 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C7orf33Q8WU49 177 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A087WVE0 104 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC179H3BU77 68 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UPK3BQ9BT76 320 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RMI2Q96E14 147 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.17□□□□□ -1.1
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