RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0QXV9 152 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A2P29034 98 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTDAPP60985 99 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 E9PLD3 99 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00158P58513 81 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C22orf24Q9Y442 160 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2BP63146 152 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM13P0DJ93 91 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf52A6NGY3 159 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0U1RRA0 63 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPREB1P12018 145 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf137Q5JT78 98 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YXY3 114 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OXTP01178 125 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00167Q96N53 147 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV7-43P04211 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF815PA8K554 130 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM17BO60830 172 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATOH7Q8N100 152 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYCBP2O75592 4640 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE10A6NGK3 116 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R378 163 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8NDZ9 215 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCE1O60756 84 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REG3GQ6UW15 175 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAND5Q8N907 189 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIRC1Q969H9 104 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFC2O95298 119 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LITAFQ99732 161 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF861PO60384 105 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2D-28P01615 120 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM238C9JI98 176 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB1D1O95968 90 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0Y9J4 135 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZVH6 145 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCR3O14931 201 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A12P80511 92 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COPS9Q8WXC6 57 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM126AQ9H061 195 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCP2Q8IVA1 136 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01600Q96MT4 127 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPANXCQ9NY87 97 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRYO14603 147 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2AP49459 152 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B5MCH6 92 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFITM1P13164 125 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPC2P61916 151 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.25□□□□□ -0.93
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