RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 DEFB4AO15263 64 aa15□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HIVEP2P31629 2446 aa15□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SPAG11BQ08648 103 aa15□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DAD1P61803 113 aa14.99□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS28P62857 69 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DEFB135Q30KP9 77 aa14.99□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf223Q8N319 242 aa14.99□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 UBL5Q9BZL1 73 aa14.99□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.98□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 IGLV6-57P01721 117 aa14.98□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.98□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZQT0 140 aa14.98□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM258P61165 79 aa14.97□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM3P98179 157 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.96□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.96□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 INAFM1C9JVW0 142 aa14.96□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LELP1Q5T871 98 aa14.96□□□□□ -0.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ENHOQ6UWT2 76 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR34Q9NV39 138 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 MTORP42345 2549 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 APOC4P55056 127 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.95□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CELA1Q9UNI1 258 aa14.94□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 Q8NAQ8 132 aa14.93□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GHRHP01286 108 aa14.92□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BQ85 93 aa14.91□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 MIFP14174 115 aa14.91□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.9□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa14.9□□□□□ -0.02
HTATSF1-201ENST00000218364 DPH3Q96FX2 82 aa14.88□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 KLK12Q9UKR0 248 aa14.88□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.87□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZQY7 126 aa14.87□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE6GP18545 87 aa14.86□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 M0R2N4 97 aa14.86□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.86□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 F8P00451 2351 aa14.86□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 BCE1O60756 84 aa14.85□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 DSCR8Q96T75 97 aa14.85□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 DIRC1Q969H9 104 aa14.84□□□□□ -0.03
HTATSF1-201ENST00000218364 HTN3P15516 51 aa14.83□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZVQ6 151 aa14.82□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.81□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.81□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.79□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.79□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 COX7BP24311 80 aa14.78□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.77□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCL6P80162 114 aa14.77□□□□□ -0.04
HTATSF1-201ENST00000218364 HAMPP81172 84 aa14.76□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV7A0A075B6U4 112 aa14.75□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 VPREB1P12018 145 aa14.74□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 C20orf197Q8N268 126 aa14.73□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 OXTP01178 125 aa14.73□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.72□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.71□□□□□ -0.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMK2N2Q96S95 79 aa14.71□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 MAST4O15021 2626 aa14.7□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 M0R378 163 aa14.7□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.68□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.68□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.67□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BNG1 76 aa14.67□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 VWFP04275 2813 aa14.67□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.66□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 WIPF1O43516 503 aa14.65□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZRU5 148 aa14.65□□□□□ -0.06
HTATSF1-201ENST00000218364 KLKP1Q107X0 134 aa14.64□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 C5orf47Q569G3 176 aa14.64□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 C15orf56Q8N910 161 aa14.64□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 H7BZZ5 65 aa14.63□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa14.62□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM236CP0DP71 79 aa14.62□□□□□ -0.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SCXQ7RTU7 201 aa14.57□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 EPM2AB3EWF7 344 aa14.56□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 F8WDY8 70 aa14.56□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 Q5XG85 94 aa14.56□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZRP5 223 aa14.55□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 ESRGQ1W209 222 aa14.52□□□□□ -0.08
HTATSF1-201ENST00000218364 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.52□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.52□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.52□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RMI2Q96E14 147 aa14.51□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZTC4 211 aa14.51□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SNURFQ9Y675 71 aa14.51□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.51□□□□□ -0.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RETNQ9HD89 108 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.5 ms