RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.21□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 C5orf52A6NGY3 159 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 S100A6P06703 90 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PRSS2P07478 247 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 XGP55808 180 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 C10orf25Q5T742 122 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 SFTA2Q6UW10 78 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 EPM2AB3EWF7 344 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 H0Y8G0 127 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PANO1I0J062 215 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKCP01834 107 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 C2orf82Q6UX34 121 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A096LNI7 61 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 AKR1D1P51857 326 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PTTG1IPP53801 180 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 CKS1BP61024 79 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 SCXQ7RTU7 201 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 C20orf202A1L168 122 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 S100A2P29034 98 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTDAPP60985 99 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 E9PLD3 99 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 LEPROTO15243 131 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 CHTF8P0CG12 524 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 HERVK_113P61574 105 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 Q6ZRP5 223 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-221ENST00000591856 NMUP48645 174 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 HERV-K104P63124 156 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 COX17Q14061 63 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A087WYN8 130 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 J3QQQ9 107 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 ERG28Q9UKR5 140 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 MAJINQ3KP22 176 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N1X5 172 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 HAMPP81172 84 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 GAGE2BQ13066 116 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 STPG4Q8N801 248 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 RYR1P21817 5038 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PNN7 141 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00587B1AMM8 73 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 GAGE2EQ4V326 116 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 HSPG2P98160 4391 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 ATOH7Q8N100 152 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 TIMM17BO60830 172 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-221ENST00000591856 HERC2O95714 4834 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM168BA1KXE4 195 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 M0QXV9 152 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 PFN2P35080 140 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 Q5VSD8 79 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-221ENST00000591856 LITAFQ99732 161 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms