RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGKCP01834 107 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RNF151Q2KHN1 245 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C10orf25Q5T742 122 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C20orf202A1L168 122 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CXCL5P42830 114 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC01545Q5VT33 79 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A096LNI7 61 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C5orf52A6NGY3 159 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDK2AP2O75956 126 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHTF8P0CG12 524 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HERVK_113P61574 105 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HAMPP81172 84 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GAGE2BQ13066 116 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LEPROTO15243 131 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AKR1D1P51857 326 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAJINQ3KP22 176 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 Q6ZSA8 131 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PANO1I0J062 215 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 J3QQQ9 107 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTTG1IPP53801 180 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XGP55808 180 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GAGE2EQ4V326 116 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SFTA2Q6UW10 78 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SCXQ7RTU7 201 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATOH7Q8N100 152 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A087WYN8 130 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PFN2P35080 140 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 Q6ZRP5 223 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STPG4Q8N801 248 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAH2Q9P225 4427 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 E9PLD3 99 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SCGB1D1O95968 90 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00158P58513 81 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HERV-K104P63124 156 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERG28Q9UKR5 140 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PKD1P98161 4303 aa4.46□□□□□ -1.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A0U1RRA0 63 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NMUP48645 174 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COX17Q14061 63 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XP32Q5T750 250 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00587B1AMM8 73 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMIM13P0DJ93 91 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A1W2PNN7 141 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM168BA1KXE4 195 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF815PA8K554 130 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM229AH3BQW9 127 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 Q8N1X5 172 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C7orf33Q8WU49 177 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A0J9YXY3 114 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EPM2AB3EWF7 344 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 M0QXV9 152 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms