RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.14□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRFP10586 1907 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 KLLNB2CW77 178 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK6Q96HP0 2047 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 S4R3F8 94 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 C15orf56Q8N910 161 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 H3BNG1 76 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PROK2Q9HC23 129 aa2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A087X002 238 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PROK1P58294 105 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 MCM3APO60318 1980 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.12□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 DSCR10P59022 87 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 IGFL2Q6UWQ7 119 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 DENND4AQ7Z401 1863 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV1-51P01701 117 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 SLURP2P0DP57 97 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXNB2O15031 1838 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 R4GN34 69 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 NACAE9PAV3 2078 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.11□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 RP1P56715 2156 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TET1Q8NFU7 2136 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 IGIPA6NJ69 53 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM186AA6NE01 2351 aa2.1□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00310P59036 64 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 Q8N377 158 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 AGRNO00468 2067 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 THSD7BQ9C0I4 1608 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZS46 218 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 UBR3Q6ZT12 1888 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 EPG5Q9HCE0 2579 aa2.09□□□□□ -2.07
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR90Q96KV7 1748 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SORL1Q92673 2214 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 MED12LQ86YW9 2145 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 CEP250Q9BV73 2442 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SCN5AQ14524 2016 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.09□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 FREM3P0C091 2139 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 KLK9Q2XQG4 91 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXNA2O75051 1894 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.08□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ASXL3Q9C0F0 2248 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM208BQ5VWN6 2430 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00315P59091 139 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 LMO4P61968 165 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.07□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZPA2 131 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 LCTP09848 1927 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRDP23468 1912 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 C9orf92A6NGG3 77 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SPRNQ5BIV9 151 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 WISP2O76076 250 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 NCOR1O75376 2440 aa2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms