RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	CXCL5	P42830	114 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	STPG4	Q8N801	248 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		5.38	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LEPROT	O15243	131 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.37	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	PFN2	P35080	140 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	AKR1D1	P51857	326 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	HAMP	P81172	84 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710		A0A096LNI7	61 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710		A0A0U1RRA0	63 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710		J3QQQ9	107 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LINC00158	P58513	81 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710		E9PLD3	99 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	PTTG1IP	P53801	180 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZRP5	223 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.34	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	PANO1	I0J062	215 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	NMU	P48645	174 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	XG	P55808	180 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	HERV-K104	P63124	156 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.33	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WYN8	130 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.32	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	COX17	Q14061	63 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZSA8	131 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.31	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710		A0A1W2PNN7	141 aa		5.3	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.3	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.3	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.29	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.29	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710		A0A0J9YXY3	114 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	PKD1	P98161	4303 aa		5.28	□□□□□ -1.56
IL6-208	ENST00000464710	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	PCP2	Q8IVA1	136 aa		5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	DAND5	Q8N907	189 aa		5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.27	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	NPC2	P61916	151 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	UBE2B	P63146	152 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.26	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.25	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710		M0QXV9	152 aa		5.25	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
IL6-208	ENST00000464710	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.25	□□□□□ -1.57

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