RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDR1-241ENST00000460944 C10orf25Q5T742 122 aa11.69□□□□□ -0.54
DDR1-241ENST00000460944 C2orf82Q6UX34 121 aa11.69□□□□□ -0.54
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DDR1-241ENST00000460944 CXCL5P42830 114 aa11.68□□□□□ -0.54
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DDR1-241ENST00000460944 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.65□□□□□ -0.54
DDR1-241ENST00000460944 C11orf86A6NJI1 115 aa11.64□□□□□ -0.55
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DDR1-241ENST00000460944 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
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DDR1-241ENST00000460944 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.41□□□□□ -0.58
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DDR1-241ENST00000460944 LINC00587B1AMM8 73 aa11.39□□□□□ -0.59
DDR1-241ENST00000460944 J3QQQ9 107 aa11.39□□□□□ -0.59
DDR1-241ENST00000460944 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
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DDR1-241ENST00000460944 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.39□□□□□ -0.59
DDR1-241ENST00000460944 C20orf202A1L168 122 aa11.38□□□□□ -0.59
DDR1-241ENST00000460944 S100A6P06703 90 aa11.38□□□□□ -0.59
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