RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396779.7

TIMM17B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 1,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST1H2BCP62807 126 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST2H2BEQ16778 126 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MAJINQ3KP22 176 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 Q5VSD8 79 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST1H2BHQ93079 126 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST1H2BNQ99877 126 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HIST1H2BMQ99879 126 aa10.93□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 A0A087WYN8 130 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 LEPROTL1O95214 131 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 C10orf25Q5T742 122 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 C2orf82Q6UX34 121 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 PTTG1IPP53801 180 aa10.91□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.91□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.91□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 NUPR1O60356 82 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SPINK8P0C7L1 97 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CXCL5P42830 114 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 GAGE2BQ13066 116 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 COX7B2Q8TF08 81 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.9□□□□□ -0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.89□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 STPG4Q8N801 248 aa10.89□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 C11orf86A6NJI1 115 aa10.88□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 F8VRH5 84 aa10.87□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.87□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.86□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 FABP4P15090 132 aa10.86□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.86□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.85□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 H0Y8G0 127 aa10.84□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ODF1Q14990 250 aa10.84□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 Q6ZRP5 223 aa10.84□□□□□ -0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 C7orf33Q8WU49 177 aa10.83□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.83□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 GAGE2EQ4V326 116 aa10.82□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.82□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.81□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM223A0PJW6 202 aa10.8□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 PLNP26678 52 aa10.8□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 SFTA2Q6UW10 78 aa10.8□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 A0A1W2PNN7 141 aa10.79□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 DPM2O94777 84 aa10.78□□□□□ -0.68
TIMM17B-202ENST00000396779 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.75□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 IGKCP01834 107 aa10.74□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM168BA1KXE4 195 aa10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 COX17Q14061 63 aa10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 MYCBP2O75592 4640 aa10.73□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 HERVK_113P61574 105 aa10.72□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 PET117Q6UWS5 81 aa10.72□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 PFN2P35080 140 aa10.71□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 ERG28Q9UKR5 140 aa10.71□□□□□ -0.69
TIMM17B-202ENST00000396779 LINC01545Q5VT33 79 aa10.7□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.7□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 M0QXV9 152 aa10.69□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 LEPROTO15243 131 aa10.69□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 HERV-K104P63124 156 aa10.69□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 C3orf79P0CE67 100 aa10.68□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.68□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.68□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.67□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 KRTDAPP60985 99 aa10.67□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.67□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 HERC1Q15751 4861 aa10.66□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 LINC00587B1AMM8 73 aa10.66□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 J3QQQ9 107 aa10.66□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 S100A6P06703 90 aa10.66□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.66□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 S100A2P29034 98 aa10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 LINC00158P58513 81 aa10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 C22orf24Q9Y442 160 aa10.65□□□□□ -0.7
TIMM17B-202ENST00000396779 C20orf202A1L168 122 aa10.64□□□□□ -0.71
TIMM17B-202ENST00000396779 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TIMM17B-202ENST00000396779 NMUP48645 174 aa10.64□□□□□ -0.71
TIMM17B-202ENST00000396779 UBE2BP63146 152 aa10.64□□□□□ -0.71
TIMM17B-202ENST00000396779 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms