RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 GCSHP23434 173 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 C16orf90A8MZG2 172 aa6.3□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00587B1AMM8 73 aa6.3□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.3□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.3□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 SCGB1D1O95968 90 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 NMUP48645 174 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP10-2P60368 255 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 KIAA0087Q14695 138 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 E9PLD3 99 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 LEPROTO15243 131 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 HERV-K104P63124 156 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZRU5 148 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV20-1-201ENST00000390394 COX17Q14061 63 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 PKD1P98161 4303 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 J3QQQ9 107 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 SLPIP03973 132 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 C2orf82Q6UX34 121 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 HERC1Q15751 4861 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 STPG4Q8N801 248 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 DPH3Q96FX2 82 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 C10orf25Q5T742 122 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 ATOH7Q8N100 152 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 ERG28Q9UKR5 140 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 PTTG1IPP53801 180 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 GAGE2BQ13066 116 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00158P58513 81 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP10-1P60331 282 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC01620Q4KN68 170 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 VAMP8Q9BV40 100 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF815PA8K554 130 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 CDK2AP2O75956 126 aa6.2□□□□□ -1.42
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TRBV20-1-201ENST00000390394 S100A12P80511 92 aa6.2□□□□□ -1.42
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TRBV20-1-201ENST00000390394 GAGE2EQ4V326 116 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZRP5 223 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZSA8 131 aa6.2□□□□□ -1.42
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TRBV20-1-201ENST00000390394 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A096LNI7 61 aa6.19□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.19□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.19□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.19□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 HSPG2P98160 4391 aa6.19□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM238C9JI98 176 aa6.18□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 TIMM17BO60830 172 aa6.18□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.18□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A0J9YXY3 114 aa6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMIM13P0DJ93 91 aa6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 PYY3Q5JQD4 70 aa6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZVH6 145 aa6.17□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A087WYN8 130 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPATA45Q537H7 98 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A0U1RRA0 63 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 DLEU1O43261 78 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 CHTF8P0CG12 524 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 COX8AP10176 69 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SCXQ7RTU7 201 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 C7orf33Q8WU49 177 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
TRBV20-1-201ENST00000390394 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMIM6P0DI80 62 aa6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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