RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-9P60411 292 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 MED12LQ86YW9 2145 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N9L7 120 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZTC4 211 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 NACAE9PAV3 2078 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-208ENST00000550358 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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PTPRB-208ENST00000550358 CADP27708 2225 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WYN8 130 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZRU5 148 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-208ENST00000550358 C22orf24Q9Y442 160 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-208ENST00000550358 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 HCG22E2RYF7 251 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00315P59091 139 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 POLEQ07864 2286 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 MDFIQ99750 246 aa5.91□□□□□ -1.46
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