RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC13O75165 2243 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CUL7Q14999 1698 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSSCA1O60232 199 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFT2D2O95562 160 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CATR1Q13166 79 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCHHQ07283 1943 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 K7EP13 123 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOC2P02655 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 S100A12P80511 92 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA0556O60303 1618 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 TET3O43151 1660 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGPP08493 103 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCN7AQ01118 1682 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TGP01266 2768 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFNGP01579 166 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSC22D3Q99576 134 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLC1P0CG04 106 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM107BQ9H098 131 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 NF1P21359 2839 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGN1P05114 100 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYOM2P54296 1465 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPINK4O60575 86 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRL2O95490 1459 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOP2BQ02880 1626 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0R2T5 61 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2D3P61077 147 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2D2P62837 147 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAPERQ9BY12 1400 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 CREBBPQ92793 2442 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 F6UZH7 168 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q0VG73 95 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 HERC1Q15751 4861 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 COX8AP10176 69 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNG11P61952 73 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCN9Q8WX39 176 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRO1933Q9H354 126 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM223BA6NKX1 122 aa-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms