RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 TNFRSF6BO95407 300 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf137Q5JT78 98 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-210ENST00000489601 IMMP2LQ96T52 175 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0087Q14695 138 aa10.06□□□□□ -0.8
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SH3BP4-210ENST00000489601 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP4-210ENST00000489601 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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SH3BP4-210ENST00000489601 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP4-210ENST00000489601 K7EMI3 77 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF861PO60384 105 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP4-210ENST00000489601 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-210ENST00000489601 C22orf24Q9Y442 160 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-210ENST00000489601 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-210ENST00000489601 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-210ENST00000489601 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-210ENST00000489601 SEC11AP67812 179 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-210ENST00000489601 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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