RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.57□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.57□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.57□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PRO1933Q9H354 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 I3L3M4 83 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 TSHBP01222 138 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 S100A12P80511 92 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 MAJINQ3KP22 176 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01545Q5VT33 79 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.56□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 RHOHQ15669 191 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 TOMM6Q96B49 74 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 RMI2Q96E14 147 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DL4Q99706 377 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 VAMP8Q9BV40 100 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.55□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 hDV102S1A0JD36 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 C20orf202A1L168 122 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 ATP5LO75964 103 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PKIAP61925 76 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 C14orf177Q52M58 125 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.54□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 MUC17Q685J3 4493 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GAGE12JA6NER3 117 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 IGIPA6NJ69 53 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00587B1AMM8 73 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS1P07477 247 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00694P0DN24 101 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GAGE1Q13065 139 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GAGE4Q13068 117 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GAGE5Q13069 117 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 GAGE13Q4V321 117 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 SPATA45Q537H7 98 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 ERASQ7Z444 233 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.53□□□□□ -1.68
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WX48 190 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WYN8 130 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 TSTD3H0UI37 97 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 CIDEAO60543 219 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 G0S2P27469 103 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2D3P61077 147 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2D2P62837 147 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZN92 141 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 KLK12Q9UKR0 248 aa4.52□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L23D6RBM5 183 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 DDTP30046 118 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 COTL1Q14019 142 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 STPG4Q8N801 248 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 FAM104AQ969W3 186 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2WQ96B02 151 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM141Q96I45 108 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 TIMM17AQ99595 171 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.51□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01549A6NIU2 74 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 F8VRH5 84 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 DPM2O94777 84 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGKCP01834 107 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGLC3P0DOY3 106 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 C14orf144Q96I85 54 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 CST9LQ9H4G1 147 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 CHTF8P0CG12 524 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 PMVKQ15126 192 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 REG3GQ6UW15 175 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 ENHOQ6UWT2 76 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.49□□□□□ -1.69
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms