RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471070.1

GSE1-208, Transcript of Gse1 coiled-coil protein, human

TSL 3

Gene GSE1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GSE1-208	ENST00000471070	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070		K7EN84	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	CRYGA	P11844	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	UBE2B	P63146	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070		M0QXV9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GSE1-208	ENST00000471070		A0A087X002	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	FCER1G	P30273	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	ZNF345	Q14585	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	NDUFA1	O15239	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	PDE6D	O43924	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070		B5MCH6	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	RAB4A	P20338	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	CEBPG	P53567	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	NRAC	Q8N912	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	ZNF861P	O60384	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GSE1-208	ENST00000471070	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070		A0A1B0GUT8	65 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070		A8MWL6	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	VCY	O14598	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	MT1H	P80294	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	HBB	P68871	147 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GSE1-208	ENST00000471070	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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