RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 PSCAO43653 123 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 XCL1P47992 114 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 FOXI1Q12951 378 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 MALP21145 153 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 WFDC2Q14508 124 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 PMVKQ15126 192 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.77□□□□□ -1.33
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GARNL3-211ENST00000460176 CST9LQ9H4G1 147 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH2Q9P225 4427 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WTM6 91 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 LEPROTL1O95214 131 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.76□□□□□ -1.33
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GARNL3-211ENST00000460176 C9orf118A6NHY6 69 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 LECT2O14960 151 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 FABP4P15090 132 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 COX6A2Q02221 97 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0J9YXV3 536 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 USP17L23D6RBM5 183 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS1P07477 247 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 C15orf56Q8N910 161 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1B0GVY2 172 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 COX7A2LO14548 114 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 IGLC3P0DOY3 106 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf38Q86SI9 138 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WZ39 114 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 S100A6P06703 90 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 HERVK_113P63121 156 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 SEC11AP67812 179 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N814 137 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.71□□□□□ -1.33
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf52A6NGY3 159 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 H0Y8G0 127 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.7□□□□□ -1.34
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GARNL3-211ENST00000460176 C11orf86A6NJI1 115 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 B5MCH6 92 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 F8VRH5 84 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 CFAP161Q6P656 301 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 C3orf79P0CE67 100 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP10-2P60368 255 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 C14orf177Q52M58 125 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 hDV102S1A0JD36 115 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 APOMO95445 188 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 S100A2P29034 98 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SLPIP03973 132 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 KRTDAPP60985 99 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SPAG11BQ08648 103 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA0087Q14695 138 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01545Q5VT33 79 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 PET117Q6UWS5 81 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 H3BRM9 83 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 DPM2O94777 84 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 SPINK8P0C7L1 97 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 PLNP26678 52 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-211ENST00000460176 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.66□□□□□ -1.34
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