RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 A6NJY4 79 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 APOMO95445 188 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 MT-ND6P03923 174 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 RAB4AP20338 218 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 S100PP25815 95 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZUT4 128 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 NUP35Q8NFH5 326 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 TSKUQ8WUA8 353 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 C5orf38Q86SI9 138 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 SPAG11BQ08648 103 aa7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf137Q5JT78 98 aa7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 IMMP2LQ96T52 175 aa7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 VCYO14598 125 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 NRACQ8N912 160 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 C2orf48Q96LS8 159 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 YPEL4Q96NS1 127 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 KIR2DL4Q99706 377 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-210ENST00000453030 COLCA2A8K830 154 aa7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 RIGQ13278 110 aa7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.13□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 PPP1R17O96001 155 aa7.12□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 FAM168BA1KXE4 195 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 RAB5AP20339 215 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM18Q96B42 140 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 A0A087WZ39 114 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV7-43P04211 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 HBBP68871 147 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 DIRC1Q969H9 104 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GXF2 115 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 IFITM10A6NMD0 228 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFA1O15239 70 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 RNF151Q2KHN1 245 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 C10orf25Q5T742 122 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.09□□□□□ -1.27
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GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-210ENST00000453030 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.09□□□□□ -1.27
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GARNL3-210ENST00000453030 H0Y9J4 135 aa7.08□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 GAGE2EQ4V326 116 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.07□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 FAM104AQ969W3 186 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 C20orf78Q9BR46 151 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GW15 77 aa7.06□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 M0QXV9 152 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 TCAPO15273 167 aa7.06□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 F8WDY8 70 aa7.05□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2BP63146 152 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 COX19Q49B96 90 aa7.05□□□□□ -1.28
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GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.03□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2D1P51668 147 aa7.03□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 C2orf82Q6UX34 121 aa7.03□□□□□ -1.28
GARNL3-210ENST00000453030 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 KIAA0087Q14695 138 aa7.02□□□□□ -1.29
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