RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WYN8 130 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 IGIPA6NJ69 53 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 MALP21145 153 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 A0A096LNI7 61 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZRU5 148 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM141Q96I45 108 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 CARD19Q96LW7 228 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 AMELXQ99217 191 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 HERC1Q15751 4861 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01546A6NGU7 62 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2D1P51668 147 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 SYCNQ0VAF6 134 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 K7EMI3 77 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 SPAG11BQ08648 103 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 MAJINQ3KP22 176 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 SVBPQ8N300 66 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 TOMM6Q96B49 74 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 YPEL4Q96NS1 127 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0J9YXV3 536 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 COX19Q49B96 90 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf25Q5T742 122 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 DPH3Q96FX2 82 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf48Q96LS8 159 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WZ39 114 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 SNAPINO95295 136 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 APOMO95445 188 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 MT-ND6P03923 174 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA0087Q14695 138 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 VCX2Q9H322 139 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 STPG4Q8N801 248 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 TIMM17AQ99595 171 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 A0A096LNJ9 63 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 NPSP0C0P6 89 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 PTTG1IPP53801 180 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE2BQ13066 116 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA5Q16718 116 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZN92 141 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PNN7 141 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 FA2HQ7L5A8 372 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 ERASQ7Z444 233 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 RNF151Q2KHN1 245 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf82Q6UX34 121 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA1O15239 70 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 G0S2P27469 103 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PMCHL1Q16048 86 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 CST9LQ9H4G1 147 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00614P0C842 121 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZRP5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 FAM168BA1KXE4 195 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 F8WDY8 70 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 HERVK_113P63121 156 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PMVKQ15126 192 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.68□□□□□ -1.34
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