RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 MT-ND6P03923 174 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 RIGQ13278 110 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 Q6ZUT4 128 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01551Q86U37 167 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 LRP2P98164 4655 aa6.36□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF727A8MUV8 499 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 SPAG11BQ08648 103 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf137Q5JT78 98 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 NRACQ8N912 160 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 C2orf48Q96LS8 159 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 KIR2DL4Q99706 377 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 OSTCQ9NRP0 149 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 RNF213Q63HN8 5207 aa6.35□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 V9GYV3 84 aa6.34□□□□□ -1.39
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R2P9O14990 202 aa6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R17O96001 155 aa6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 AKAP14Q86UN6 197 aa6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM18Q96B42 140 aa6.33□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.32□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.32□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.31□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.31□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.31□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.31□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 FAM168BA1KXE4 195 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV7-43P04211 117 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 CKS2P33552 79 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 ADIRFQ15847 76 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 C20orf78Q9BR46 151 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 A0A087WZ39 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00862A6NCI5 91 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 IFITM10A6NMD0 228 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 NDUFA1O15239 70 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLRN3-201ENST00000368671 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 C10orf25Q5T742 122 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 DIRC1Q969H9 104 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 IMMP2LQ96T52 175 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 TCAPO15273 167 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 HBBP68871 147 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 GAGE2EQ4V326 116 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 FAM104AQ969W3 186 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.28□□□□□ -1.4
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 D6R8Y8 96 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 F8WDY8 70 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 H0Y9J4 135 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 NPYP01303 97 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 NAT8Q9UHE5 227 aa6.27□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GW15 77 aa6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2BP63146 152 aa6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.26□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 C9JQL5 133 aa6.25□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 F8W036 122 aa6.25□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 M0QXV9 152 aa6.25□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 LPAP08519 4548 aa6.25□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 S100A8P05109 93 aa6.24□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.24□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GXF2 115 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 RAB5AP20339 215 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2D1P51668 147 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0087Q14695 138 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 C2orf82Q6UX34 121 aa6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.22□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 PPBPP02775 128 aa6.22□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.22□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 PEA15Q15121 130 aa6.22□□□□□ -1.41
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.22□□□□□ -1.41
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