RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 VCYO14598 125 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 FOXI1Q12951 378 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 PEA15Q15121 130 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 ADIRFQ15847 76 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 NAT8Q9UHE5 227 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A087WYN8 130 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP1R2P9O14990 202 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 FCER1GP30273 86 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 XCL1P47992 114 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 SS18Q15532 418 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 CLLU1Q5K131 121 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRVP-204ENST00000639439 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1B0GW15 77 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 SMKR1H3BMG3 65 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CCL25O15444 150 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CHTF8P0CG12 524 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 NRACQ8N912 160 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 KIR2DL4Q99706 377 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 LINC00862A6NCI5 91 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 C9JQL5 133 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 COX6A2Q02221 97 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 TCAPO15273 167 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 S100A8P05109 93 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CAMPP49913 170 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 C7orf33Q8WU49 177 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM18Q96B42 140 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 C20orf78Q9BR46 151 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 MAJINQ3KP22 176 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 F8W036 122 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CKS2P33552 79 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRVP-204ENST00000639439 HBBP68871 147 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 Q6ZRU5 148 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 CARD19Q96LW7 228 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 MALP21145 153 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 STPG4Q8N801 248 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 COX7A2LO14548 114 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 TNFRSF6BO95407 300 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 SYCNQ0VAF6 134 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A096LNI7 61 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1B0GXF2 115 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 PHOX2AO14813 284 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 PPBPP02775 128 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 COMMD7Q86VX2 200 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 D6R8Y8 96 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 Q6ZUT4 128 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 APOMO95445 188 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRVP-204ENST00000639439 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 NPYP01303 97 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 ORMDL3Q8N138 153 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 C2orf48Q96LS8 159 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 UQCC3Q6UW78 93 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 C5orf38Q86SI9 138 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB5AP20339 215 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRVP-204ENST00000639439 PTTG1IPP53801 180 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms