RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 REG3GQ6UW15 175 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 FAM231DQ6ZW35 169 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 FAM210AQ96ND0 272 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 MRAP2Q96G30 205 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 ST20Q9HBF5 79 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 SYCNQ0VAF6 134 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 SS18Q15532 418 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZRP5 223 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM250H0YL14 139 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 CT83Q5H943 113 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 PTTG1IPP53801 180 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 CAMPP49913 170 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 BORCS7Q96B45 105 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRF-216ENST00000617451 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GUT8 65 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 RAB4AP20338 218 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 ISOC2Q96AB3 205 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 HIGD1CA8MV81 97 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 GAGE2BQ13066 116 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 TSKUQ8WUA8 353 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PNN7 141 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 MALP21145 153 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 NUP35Q8NFH5 326 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 COX7A2LO14548 114 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 CEBPGP53567 150 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 AMN1Q8IY45 258 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 VCYO14598 125 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 BLOC1S1P78537 153 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01551Q86U37 167 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 APOMO95445 188 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 FCER1GP30273 86 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 SMKR1H3BMG3 65 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf48Q96LS8 159 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 OSTCQ9NRP0 149 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 NRACQ8N912 160 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R17O96001 155 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf38Q86SI9 138 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 RIGQ13278 110 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DL4Q99706 377 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-216ENST00000617451 MT-ND6P03923 174 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 LPAP08519 4548 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF727A8MUV8 499 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZUT4 128 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 V9GYV3 84 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 RNF151Q2KHN1 245 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R2P9O14990 202 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 SPAG11BQ08648 103 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf137Q5JT78 98 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM18Q96B42 140 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-216ENST00000617451 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf78Q9BR46 151 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 FAM104AQ969W3 186 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00862A6NCI5 91 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 F8WDY8 70 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 RPL32P62910 135 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP14Q86UN6 197 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 IMMP2LQ96T52 175 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 TCAPO15273 167 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV7-43P04211 117 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRF-216ENST00000617451 DIRC1Q969H9 104 aa15.15■□□□□ 0.02
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