RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PNN7	141 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338		I3L3M4	83 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	OCC1	Q8TAD7	63 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PMCH	P20382	165 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMP	P49913	170 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SS18	Q15532	418 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC2	Q02817	5179 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-233	ENST00000602338	COX7A2L	O14548	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	APOM	O95445	188 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MT-ND6	P03923	174 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MWL6	223 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SMKR1	H3BMG3	65 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MAL	P21145	153 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB4A	P20338	218 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CT83	Q5H943	113 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZUT4	128 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GUT8	65 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HIGD1C	A8MV81	97 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM250	H0YL14	139 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC51B	Q86UW2	128 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NRAC	Q8N912	160 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FCER1G	P30273	86 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CEBPG	P53567	150 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TSKU	Q8WUA8	353 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-233	ENST00000602338		H0Y9J4	135 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	VCY	O14598	125 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01551	Q86U37	167 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WZ39	114 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	OSTC	Q9NRP0	149 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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