RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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GGA3-204ENST00000578208 TMEM218A2RU14 115 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-204ENST00000578208 COMMD7Q86VX2 200 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-204ENST00000578208 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-204ENST00000578208 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.53□□□□□ -1.2
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GGA3-204ENST00000578208 MALP21145 153 aa7.51□□□□□ -1.21
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GGA3-204ENST00000578208 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-204ENST00000578208 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GGA3-204ENST00000578208 K7EMI3 77 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-204ENST00000578208 APOMO95445 188 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-204ENST00000578208 NDUFA5Q16718 116 aa7.48□□□□□ -1.21
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GGA3-204ENST00000578208 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-204ENST00000578208 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-204ENST00000578208 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-204ENST00000578208 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.45□□□□□ -1.22
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GGA3-204ENST00000578208 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GGA3-204ENST00000578208 FAT1Q14517 4588 aa7.45□□□□□ -1.22
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