RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 NCR2O95944 276 aa9.67□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.67□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 A0A0J9YXV3 536 aa9.66□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 CCL25O15444 150 aa9.66□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.66□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 GAS8-AS1O95177 125 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 ADCYAP1P18509 176 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 OCC1Q8TAD7 63 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 CARD19Q96LW7 228 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 SEC11CQ9BY50 192 aa9.65□□□□□ -0.86
NME3-211ENST00000568561 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 FAM231BA6NCW3 169 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 ZNF727A8MUV8 499 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 H7C423 109 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 CEBPGP53567 150 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.64□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 F8W036 122 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 PMCHP20382 165 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-8P60410 259 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 TMEM101Q96IK0 257 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 BTF3L4Q96K17 158 aa9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 I3L3M4 83 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 TSHBP01222 138 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 REG3GQ6UW15 175 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 NAT8Q9UHE5 227 aa9.62□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SYCNQ0VAF6 134 aa9.61□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 ESDP10768 282 aa9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 GAGE2BQ13066 116 aa9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 Q6ZRP5 223 aa9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 LINC01551Q86U37 167 aa9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 MRAP2Q96G30 205 aa9.6□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 CAMPP49913 170 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 SS18Q15532 418 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 ST20Q9HBF5 79 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 LPAP08519 4548 aa9.59□□□□□ -0.87
NME3-211ENST00000568561 PTTG1IPP53801 180 aa9.58□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.58□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.58□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.58□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.57□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 ISOC2Q96AB3 205 aa9.57□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 A0A1W2PNN7 141 aa9.56□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 A8MWL6 223 aa9.56□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 APOC3P02656 99 aa9.56□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.56□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 SMKR1H3BMG3 65 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 ADIRFQ15847 76 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 SVBPQ8N300 66 aa9.55□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 MALP21145 153 aa9.54□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 AMN1Q8IY45 258 aa9.54□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 BORCS7Q96B45 105 aa9.54□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 OSTCQ9NRP0 149 aa9.54□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 COX7A2LO14548 114 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 SNAPINO95295 136 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 NUP35Q8NFH5 326 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.53□□□□□ -0.88
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GUT8 65 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 HIGD1CA8MV81 97 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 RAB4AP20338 218 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 RHEBQ15382 184 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 CT83Q5H943 113 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.52□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 APOMO95445 188 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 MT-ND6P03923 174 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 FCER1GP30273 86 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 Q6ZUT4 128 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 C5orf38Q86SI9 138 aa9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 PPP1R2P9O14990 202 aa9.5□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 MT-ND4LP03901 98 aa9.5□□□□□ -0.89
NME3-211ENST00000568561 TSKUQ8WUA8 353 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms