RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOXI1Q12951 378 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZNX1 250 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MED9Q9NWA0 146 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEX261Q6UWH6 196 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZRP5 223 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM101Q96IK0 257 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTF3L4Q96K17 158 aa5.85□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PMCHP20382 165 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 XCL1P47992 114 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ODF1Q14990 250 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CARD19Q96LW7 228 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM210AQ96ND0 272 aa5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 I3L3M4 83 aa5.83□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.83□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCL25O15444 150 aa5.83□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM231BA6NCW3 169 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCL2P10415 239 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYCNQ0VAF6 134 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SS18Q15532 418 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OCC1Q8TAD7 63 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.82□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 K7EN84 100 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ESDP10768 282 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ISOC2Q96AB3 205 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRAP2Q96G30 205 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.81□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A8MWL6 223 aa5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAMPP49913 170 aa5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTTG1IPP53801 180 aa5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ST20Q9HBF5 79 aa5.8□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSHBP01222 138 aa5.79□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE2BQ13066 116 aa5.79□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.79□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MALP21145 153 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BORCS7Q96B45 105 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.78□□□□□ -1.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1W2PNN7 141 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COX7A2LO14548 114 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAS8-AS1O95177 125 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CT83Q5H943 113 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC51BQ86UW2 128 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUP35Q8NFH5 326 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GUT8 65 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM250H0YL14 139 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 APOMO95445 188 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT-ND6P03923 174 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C2orf48Q96LS8 159 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.76□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LPAP08519 4548 aa5.75□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VCYO14598 125 aa5.75□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB4AP20338 218 aa5.75□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FCER1GP30273 86 aa5.75□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIGD1CA8MV81 97 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP1R17O96001 155 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF151Q2KHN1 245 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C1orf137Q5JT78 98 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSKUQ8WUA8 353 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.74□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.73□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C5orf38Q86SI9 138 aa5.73□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AMN1Q8IY45 258 aa5.73□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.73□□□□□ -1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DIRC1Q969H9 104 aa5.73□□□□□ -1.49
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