RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	CT83	Q5H943	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	RAB4A	P20338	218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	CARD19	Q96LW7	228 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GNPTG-209	ENST00000534197	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	AMN1	Q8IY45	258 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A1B0GUT8	65 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	SS18	Q15532	418 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	SYCN	Q0VAF6	134 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A0J9YXV3	536 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	KRTAP10-8	P60410	259 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	NRAC	Q8N912	160 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	CAMP	P49913	170 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197		V9GYV3	84 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	RNF213	Q63HN8	5207 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A1W2PNN7	141 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	VCY	O14598	125 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197		Q6ZRP5	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	FCER1G	P30273	86 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GNPTG-209	ENST00000534197	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	COX7A2L	O14548	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	RIG	Q13278	110 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197		Q6ZUT4	128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	MAL	P21145	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	REG3G	Q6UW15	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	C5orf38	Q86SI9	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	APOM	O95445	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GNPTG-209	ENST00000534197		C9JQL5	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	PPP1R17	O96001	155 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	C2orf48	Q96LS8	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	SPAG11B	Q08648	103 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	ADIRF	Q15847	76 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	TNFRSF6B	O95407	300 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	C10orf25	Q5T742	122 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GNPTG-209	ENST00000534197	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GNPTG-209	ENST00000534197	MT-ND6	P03923	174 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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