RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 OCC1Q8TAD7 63 aa9.54□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 CARD19Q96LW7 228 aa9.54□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 IFITM2Q01629 132 aa9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 FOXI1Q12951 378 aa9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 LINC01600Q96MT4 127 aa9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 CNFNQ9BYD5 112 aa9.53□□□□□ -0.88
BRPF3-210ENST00000532538 MRAP2Q96G30 205 aa9.52□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 ST20Q9HBF5 79 aa9.52□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.51□□□□□ -0.89
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BRPF3-210ENST00000532538 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.51□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 A8MWL6 223 aa9.5□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 MALP21145 153 aa9.5□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 GAGE2BQ13066 116 aa9.5□□□□□ -0.89
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BRPF3-210ENST00000532538 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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BRPF3-210ENST00000532538 C9JQL5 133 aa9.49□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 SYCNQ0VAF6 134 aa9.49□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 Q6ZRP5 223 aa9.49□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.49□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 LINC01551Q86U37 167 aa9.49□□□□□ -0.89
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BRPF3-210ENST00000532538 NAT8Q9UHE5 227 aa9.49□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 A0A0J9YXV3 536 aa9.48□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 FAM231BA6NCW3 169 aa9.47□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 CAMPP49913 170 aa9.47□□□□□ -0.89
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BRPF3-210ENST00000532538 UQCC3Q6UW78 93 aa9.47□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.47□□□□□ -0.89
BRPF3-210ENST00000532538 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TSHBP01222 138 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 FCER1GP30273 86 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 CT83Q5H943 113 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 OSTCQ9NRP0 149 aa9.46□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.45□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 ESDP10768 282 aa9.45□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.45□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.45□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.44□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1B0GUT8 65 aa9.44□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.43□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 COX7A2LO14548 114 aa9.43□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 MT-ND6P03923 174 aa9.43□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 COMMD7Q86VX2 200 aa9.43□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.42□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 AMN1Q8IY45 258 aa9.42□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TSKUQ8WUA8 353 aa9.42□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.42□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 LINC00862A6NCI5 91 aa9.41□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 SMKR1H3BMG3 65 aa9.41□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 VCYO14598 125 aa9.41□□□□□ -0.9
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BRPF3-210ENST00000532538 RAB4AP20338 218 aa9.41□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 KIR2DL4Q99706 377 aa9.41□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM218A2RU14 115 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 PPP1R2P9O14990 202 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP10-8P60410 259 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 RIGQ13278 110 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 C5orf38Q86SI9 138 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM18Q96B42 140 aa9.4□□□□□ -0.9
BRPF3-210ENST00000532538 F8W036 122 aa9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 PPP1R17O96001 155 aa9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 C1orf137Q5JT78 98 aa9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 NUP35Q8NFH5 326 aa9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 V9GYV3 84 aa9.39□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1W2PNN7 141 aa9.38□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 MT-ND4LP03901 98 aa9.38□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.38□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 TNXBP22105 4242 aa9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 SPAG11BQ08648 103 aa9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 SEC11CQ9BY50 192 aa9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.37□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.36□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 C2orf48Q96LS8 159 aa9.36□□□□□ -0.91
BRPF3-210ENST00000532538 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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