RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494067.5

CTDSP1-212, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP1, Length 362 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-212ENST00000494067 XCL1P47992 114 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 MAJINQ3KP22 176 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 C9JQL5 133 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 VCYO14598 125 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 CCL25O15444 150 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 TSHBP01222 138 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 ESDP10768 282 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 RAB4AP20338 218 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 FOXI1Q12951 378 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 AMN1Q8IY45 258 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 KIR2DL4Q99706 377 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 V9GYV3 84 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 SMKR1H3BMG3 65 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 MALP21145 153 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 STPG4Q8N801 248 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 TMEM18Q96B42 140 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 PHOX2AO14813 284 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 PPP1R2P9O14990 202 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 ISOC2Q96AB3 205 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 CARD19Q96LW7 228 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-212ENST00000494067 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.46□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 NUP35Q8NFH5 326 aa8.46□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 TCAPO15273 167 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 PEA15Q15121 130 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 ADIRFQ15847 76 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 NRACQ8N912 160 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 NAT8Q9UHE5 227 aa8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A1B0GW15 77 aa8.44□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00862A6NCI5 91 aa8.44□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 SYCNQ0VAF6 134 aa8.44□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A096LNI7 61 aa8.43□□□□□ -1.06
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CTDSP1-212ENST00000494067 S100A8P05109 93 aa8.43□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 MT1HL1P0DM35 61 aa8.43□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 CAMPP49913 170 aa8.43□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 F8W036 122 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 CKS2P33552 79 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 C20orf78Q9BR46 151 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.41□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.41□□□□□ -1.06
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CTDSP1-212ENST00000494067 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.41□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 GAGE2BQ13066 116 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 FAM104AQ969W3 186 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP1-212ENST00000494067 TNXBP22105 4242 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 PTTG1IPP53801 180 aa8.38□□□□□ -1.07
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CTDSP1-212ENST00000494067 HBBP68871 147 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 REG3GQ6UW15 175 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 Q6ZRP5 223 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 C5orf38Q86SI9 138 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 TNFRSF6BO95407 300 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 PPBPP02775 128 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 Q6ZUT4 128 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 C2orf48Q96LS8 159 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 D6R8Y8 96 aa8.36□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 RAB5AP20339 215 aa8.36□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.36□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.36□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A1B0GXF2 115 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 F8WDY8 70 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTDSP1-212ENST00000494067 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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