RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 TSHBP01222 138 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 PPBPP02775 128 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 ESDP10768 282 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 CKS2P33552 79 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 C7orf33Q8WU49 177 aa8.77□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 MALP21145 153 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 XCL1P47992 114 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 CAMPP49913 170 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 HBBP68871 147 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 FAT1Q14517 4588 aa8.75□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 APOMO95445 188 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 OXTP01178 125 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 A0A1B0GVG6 124 aa8.74□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 PHOX2AO14813 284 aa8.74□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.73□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.73□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 C15orf56Q8N910 161 aa8.73□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.73□□□□□ -1.01
IRF1-210ENST00000493208 COX7A2LO14548 114 aa8.72□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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IRF1-210ENST00000493208 SMKR1H3BMG3 65 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 MT-ND4LP03901 98 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 ORMDL3Q8N138 153 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 NRACQ8N912 160 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 CARD19Q96LW7 228 aa8.71□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 TNFRSF6BO95407 300 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 COX6A2Q02221 97 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 MAJINQ3KP22 176 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.7□□□□□ -1.02
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IRF1-210ENST00000493208 D6R8Y8 96 aa8.69□□□□□ -1.02
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IRF1-210ENST00000493208 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 C9JQL5 133 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 GAS8-AS1O95177 125 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 G0S2P27469 103 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 F8WDY8 70 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 Q6ZRU5 148 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 SLPIP03973 132 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 STPG4Q8N801 248 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 C2orf48Q96LS8 159 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 A0A1B0GXF2 115 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 K7EMI3 77 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 Q6ZN92 141 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 PRELID3AQ96N28 172 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-210ENST00000493208 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.64□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 IFITM10A6NMD0 228 aa8.64□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 CHTF8P0CG12 524 aa8.64□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.64□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.64□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 PANO1I0J062 215 aa8.63□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.63□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 Q6ZUT4 128 aa8.63□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 MYCBP2O75592 4640 aa8.63□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 NPYP01303 97 aa8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 SPAG11BQ08648 103 aa8.62□□□□□ -1.03
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