RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 A0A096LNI7 61 aa12.94□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.94□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 IFITM2Q01629 132 aa12.94□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 AMTP48728 403 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 NIT2Q9NQR4 276 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZRP5 223 aa12.92□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.92□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa12.91□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 COTL1Q14019 142 aa12.91□□□□□ -0.34
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NELFE-210ENST00000491139 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NELFE-210ENST00000491139 PKIGQ9Y2B9 76 aa12.9□□□□□ -0.34
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NELFE-210ENST00000491139 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.86□□□□□ -0.35
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NELFE-210ENST00000491139 FOXI1Q12951 378 aa12.83□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NELFE-210ENST00000491139 A0A1B0GXF2 115 aa12.82□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 AMN1Q8IY45 258 aa12.82□□□□□ -0.36
NELFE-210ENST00000491139 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.82□□□□□ -0.36
NELFE-210ENST00000491139 CARD19Q96LW7 228 aa12.82□□□□□ -0.36
NELFE-210ENST00000491139 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.81□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NELFE-210ENST00000491139 TMEM218A2RU14 115 aa12.79□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 ADCYAP1P18509 176 aa12.79□□□□□ -0.36
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.76□□□□□ -0.37
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NELFE-210ENST00000491139 NRACQ8N912 160 aa12.76□□□□□ -0.37
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NELFE-210ENST00000491139 CAMPP49913 170 aa12.75□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
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NELFE-210ENST00000491139 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 IMMP2LQ96T52 175 aa12.75□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.75□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.74□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 BTF3L4Q96K17 158 aa12.74□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.73□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.73□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 TSHBP01222 138 aa12.73□□□□□ -0.37
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NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PNN7 141 aa12.72□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 ESDP10768 282 aa12.72□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.72□□□□□ -0.37
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NELFE-210ENST00000491139 SS18Q15532 418 aa12.71□□□□□ -0.37
NELFE-210ENST00000491139 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 SMKR1H3BMG3 65 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 VCYO14598 125 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 TMEM242Q9NWH2 141 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 MUC2Q02817 5179 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 TCAPO15273 167 aa12.69□□□□□ -0.38
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