RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475960.1

RBM34-206, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 477 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-206	ENST00000475960	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	TMBIM6	P55061	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RBM34-206	ENST00000475960		A0A087WXM4	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960		H3BMQ9	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	APOM	O95445	188 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	BCL2	P10415	239 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	MED28	Q9H204	178 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960		A0A1W2PPV4	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	XCL1	P47992	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	UBE2B	P63146	152 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	CXCL6	P80162	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	MT1H	P80294	61 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	ZNF861P	O60384	105 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	SH2D1A	O60880	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	NDUFB6	O95139	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	COTL1	Q14019	142 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM34-206	ENST00000475960	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960		M0QXV9	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CCL25	O15444	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CTAG1A	P78358	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960		Q86TA4	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960		M0QY20	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960		M0R2T5	61 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	MGP	P08493	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CRIP1	P50238	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	SS18	Q15532	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960		A0A1B0GVG6	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	ESD	P10768	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	PEX7	O00628	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	COX7A2L	O14548	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	NUPR1	O60356	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	GCHFR	P30047	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	DEFA3	P59666	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	UBE2G1	P62253	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CENPX	A8MT69	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	SNAI2	O43623	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	CXCL1	P09341	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM34-206	ENST00000475960	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms